Le analisi di prefattibilità sono il principale strumento per verificare preliminarmente le condizioni di fattibilità connesse allo sviluppo dei Poli, attraverso l'analisi delle candidature e l'individuazione e valutazione degli interventi in grado di elevare la loro attrattività ed il loro contributo allo sviluppo del territorio.
La prefattibilità si articola su quattro ambiti di valutazione:
Nel corso della seconda metà del 2008, su indicazione del Comitato Scientifico di indirizzo e di alta sorveglianza, sono state condotte 8 analisi di prefattibilità sui Poli del Golfo di Napoli, di Taranto, di Palermo, di Sibari, di Melfi - Venosa, de L'Aquila, di Sassari - Porto Torres e di Sepino.
Attualmente sono in corso le analisi di prefattibilità relative a 9 nuove ulteriori candidature indicate dal Comitato: il Polo di Napoliper la Campania, i Poli di Otranto, Castel del Monte e di Brindisi per la Puglia, il Polo di Olbia per la Sardegna, quelli della Locride per la Calabria e del Metaponto per la Basilicata, i Poli di Trapani e Ragusa per la Sicilia.